关于自适应梯度方法等自适应梯度方法等训练动力的知之甚少。在本文中,我们阐明了这些算法在全批处理和足够大的批处理设置中的行为。具体而言,我们从经验上证明,在全批训练中,预处理的Hessian的最大特征值通常在某个数值下平衡 - 梯度下降算法的稳定性阈值。对于带有步长$ \ eta $和$ \ beta_1 = 0.9 $的Adam,此稳定性阈值为$ 38/\ eta $。在Minibatch培训期间发生了类似的影响,尤其是随着批处理大小的增长。然而,即使自适应方法在``稳定性的自适应边缘''(AEOS)上训练,但它们在该制度中的行为与EOS的非自适应方法的行为有很大不同。 EOS处的非自适应算法被阻止进入损失景观的高曲率区域,而AEOS的自适应梯度方法可以继续前进到高外观区域,同时适应预先调节器以补偿。我们的发现可以成为社区对深度学习中适应性梯度方法的未来理解的基础。
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贝叶斯优化(BO)已成为许多昂贵现实世界功能的全球优化的流行策略。与普遍认为BO适合优化黑框功能的信念相反,它实际上需要有关这些功能特征的域知识才能成功部署BO。这样的领域知识通常表现在高斯流程先验中,这些先验指定了有关功能的初始信念。但是,即使有专家知识,选择先验也不是一件容易的事。对于复杂的机器学习模型上的超参数调谐问题尤其如此,在这种模型中,调整目标的景观通常很难理解。我们寻求一种设定这些功能性先验的替代实践。特别是,我们考虑了从类似功能的数据中,使我们可以先验地进行更紧密的分布。为了验证我们在现实的模型培训设置中的方法,我们通过训练在流行图像和文本数据集上的数以万计的近状态模型配置来收集了大型多任务超参数调谐数据集,以及蛋白质序列数据集。我们的结果表明,平均而言,我们的方法能够比最佳竞争方法更有效地定位良好的超参数。
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黑匣子优化需要指定搜索空间以探索解决方案,例如解决方案。 D维紧凑空间,此选择对于以合理的预算获得最佳结果至关重要。不幸的是,在许多应用中确定高质量的搜索空间可能具有挑战性。例如,当在给出有限的预算时调整机器学习管道的机器学习管道时,必须在不包括潜在有前途的地区之间进行平衡,并将搜索空间保持足够小以易于发动。这项工作的目标是激励 - 通过调整深度神经网络的示例应用程序 - 预测预算条件的搜索空间质量的问题,以及提供基于应用于a的实用程序功能的简单评分方法概率响应表面模型,类似于贝叶斯优化。我们表明我们所呈现的方法可以在各种情况下计算有意义的预算条件分数。我们还提供实验证据,即精确的分数可用于构建和修剪搜索空间。最终,我们认为评分搜索空间应该成为深度学习实验工作流程中的标准实践。
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贝叶斯优化(BO)已成为许多昂贵现实世界功能的全球优化的流行策略。与普遍认为BO适合优化黑框功能的信念相反,它实际上需要有关这些功能特征的域知识才能成功部署BO。这样的领域知识通常表现在高斯流程先验中,这些先验指定了有关功能的初始信念。但是,即使有专家知识,选择先验也不是一件容易的事。对于复杂的机器学习模型上的超参数调谐问题尤其如此,在这种模型中,调整目标的景观通常很难理解。我们寻求一种设定这些功能性先验的替代实践。特别是,我们考虑了从类似功能的数据中,使我们可以先验地进行更紧密的分布。从理论上讲,我们与预先训练的先验表示对BO的遗憾。为了验证我们在现实的模型培训设置中的方法,我们通过训练在流行图像和文本数据集上的数以万计的近状态模型配置来收集了大型多任务超参数调谐数据集,以及蛋白质序列数据集。我们的结果表明,平均而言,我们的方法能够比最佳竞争方法更有效地定位良好的超参数。
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Supervised learning on molecules has incredible potential to be useful in chemistry, drug discovery, and materials science. Luckily, several promising and closely related neural network models invariant to molecular symmetries have already been described in the literature. These models learn a message passing algorithm and aggregation procedure to compute a function of their entire input graph. At this point, the next step is to find a particularly effective variant of this general approach and apply it to chemical prediction benchmarks until we either solve them or reach the limits of the approach. In this paper, we reformulate existing models into a single common framework we call Message Passing Neural Networks (MPNNs) and explore additional novel variations within this framework. Using MPNNs we demonstrate state of the art results on an important molecular property prediction benchmark; these results are strong enough that we believe future work should focus on datasets with larger molecules or more accurate ground truth labels.Recently, large scale quantum chemistry calculation and molecular dynamics simulations coupled with advances in high throughput experiments have begun to generate data at an unprecedented rate. Most classical techniques do not make effective use of the larger amounts of data that are now available. The time is ripe to apply more powerful and flexible machine learning methods to these problems, assuming we can find models with suitable inductive biases. The symmetries of atomic systems suggest neural networks that operate on graph structured data and are invariant to graph isomorphism might also be appropriate for molecules. Sufficiently successful models could someday help automate challenging chemical search problems in drug discovery or materials science.In this paper, our goal is to demonstrate effective machine learning models for chemical prediction problems
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通用数据模型解决了标准化电子健康记录(EHR)数据的许多挑战,但无法将其集成深度表型所需的资源。开放的生物学和生物医学本体论(OBO)铸造本体论提供了可用于生物学知识的语义计算表示,并能够整合多种生物医学数据。但是,将EHR数据映射到OBO Foundry本体论需要大量的手动策展和域专业知识。我们介绍了一个框架,用于将观察性医学成果合作伙伴关系(OMOP)标准词汇介绍给OBO铸造本体。使用此框架,我们制作了92,367条条件,8,615种药物成分和10,673个测量结果的映射。域专家验证了映射准确性,并且在24家医院进行检查时,映射覆盖了99%的条件和药物成分和68%的测量结果。最后,我们证明OMOP2OBO映射可以帮助系统地识别可能受益于基因检测的未诊断罕见病患者。
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在高风险领域中采用卷积神经网络(CNN)模型受到了他们无法满足社会对决策透明度的需求的阻碍。到目前为止,已经出现了越来越多的方法来开发可通过设计解释的CNN模型。但是,这样的模型无法根据人类的看法提供解释,同时保持有能力的绩效。在本文中,我们通过实例化固有可解释的CNN模型的新颖的一般框架来应对这些挑战,该模型名为E pluribus unum unum Change Chandn(EPU-CNN)。 EPU-CNN模型由CNN子网络组成,每个工程都会收到表达感知特征的输入图像的不同表示,例如颜色或纹理。 EPU-CNN模型的输出由分类预测及其解释组成,其基于输入图像不同区域的感知特征的相对贡献。 EPU-CNN模型已在各种可公开可用的数据集以及贡献的基准数据集上进行了广泛的评估。医学数据集用于证明EPU-CNN在医学中对风险敏感的决策的适用性。实验结果表明,与其他CNN体系结构相比,EPU-CNN模型可以实现可比或更好的分类性能,同时提供人类可感知的解释。
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我们从一组稀疏的光谱时间序列中构建了一个物理参数化的概率自动编码器(PAE),以学习IA型超新星(SNE IA)的内在多样性。 PAE是一个两阶段的生成模型,由自动编码器(AE)组成,该模型在使用归一化流(NF)训练后概率地解释。我们证明,PAE学习了一个低维的潜在空间,该空间可捕获人口内存在的非线性特征范围,并且可以直接从数据直接从数据中准确地对整个波长和观察时间进行精确模拟SNE IA的光谱演化。通过引入相关性惩罚项和多阶段训练设置以及我们的物理参数化网络,我们表明可以在训练期间分离内在和外在的可变性模式,从而消除了需要进行额外标准化的其他模型。然后,我们在SNE IA的许多下游任务中使用PAE进行越来越精确的宇宙学分析,包括自动检测SN Outliers,与数据分布一致的样本的产生以及在存在噪音和不完整数据的情况下解决逆问题限制宇宙距离测量。我们发现,与以前的研究相一致的最佳固有模型参数数量似乎是三个,并表明我们可以用$ 0.091 \ pm 0.010 $ mag标准化SNE IA的测试样本,该样本对应于$ 0.074 \ pm。 0.010 $ mag如果删除了特殊的速度贡献。训练有素的模型和代码在\ href {https://github.com/georgestein/supaernova} {github.com/georgestein/supaernova}上发布
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心律不齐的右心肌病(ARVC)是一种遗传性心肌疾病,在患者生命的第二和十年之间出现,导致35岁之前的心脏突然死亡的20%。在心电图(ECG)上,在降低过早心血管死亡率中可能具有至关重要的作用。在我们的分析中,我们首先概述了基于纸张的ECG信号的数字化过程,该空间过滤器旨在消除数据集图像中与ECG波形无关的黑暗区域,从而产生不良的噪声。接下来,我们建议使用低 - 复杂性卷积神经网络来检测心律失常心脏病,迄今为止尚未通过使用深度学习方法来研究,迄今为止的使用,达到高分类准确性,即99.98%的训练和98.6%测试准确性,与其他心律失常异常相反,在疾病上,其主要鉴定标准是ECG形态的无限千伏变化。最后,通过进行光谱分析,我们研究了与ARVC患者相对应的正常ECG和ECG之间频率领域的显着区别。在我们遇到统计学上显着分化的18个频率中,有16个中,正常的心电图的特征是与异常相比更大的归一化振幅。本文进行的总体研究强调了将数学方法整合到各种疾病的检查和有效诊断中的重要性,旨在为他们的成功治疗做出重大贡献。
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超越地球轨道的人类空间勘探将涉及大量距离和持续时间的任务。为了有效减轻无数空间健康危害,数据和空间健康系统的范式转移是实现地球独立性的,而不是Earth-Reliance所必需的。有希望在生物学和健康的人工智能和机器学习领域的发展可以解决这些需求。我们提出了一个适当的自主和智能精密空间健康系统,可以监控,汇总和评估生物医学状态;分析和预测个性化不良健康结果;适应并响应新累积的数据;并提供对其船员医务人员的个人深度空间机组人员和迭代决策支持的预防性,可操作和及时的见解。在这里,我们介绍了美国国家航空航天局组织的研讨会的建议摘要,以便在太空生物学和健康中未来的人工智能应用。在未来十年,生物监测技术,生物标志科学,航天器硬件,智能软件和简化的数据管理必须成熟,并编织成精确的空间健康系统,以使人类在深空中茁壮成长。
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