估算高维观测数据的个性化治疗效果在实验设计不可行,不道德或昂贵的情况下是必不可少的。现有方法依赖于拟合对治疗和控制人群的结果的深层模型。然而,当测量单独的结果是昂贵的时,就像肿瘤活检一样,需要一种用于获取每种结果的样本有效的策略。深度贝叶斯主动学习通过选择具有高不确定性的点来提供高效数据采集的框架。然而,现有方法偏置训练数据获取对处理和控制群体之间的非重叠支持区域。这些不是样本效率,因为在这些区域中不可识别治疗效果。我们介绍了因果关系,贝叶斯采集函数接地的信息理论,使数据采集朝向具有重叠支持的地区,以最大限度地提高学习个性化治疗效果的采样效率。我们展示了拟议的综合和半合成数据集IHDP和CMNIST上提出的收购策略及其扩展的表现,旨在模拟常见的数据集偏差和病理学。
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在Mackay(1992)上展开,我们认为,用于主动学习的基于模式的方法 - 类似的基于模型 - 如秃顶 - 具有基本的缺点:它们未直接解释输入变量的测试时间分布。这可以导致采集策略中的病理,因为模型参数的最大信息是最大信息,可能不是最大地信息,例如,当池集中的数据比最终预测任务的数据更大时,或者池和试验样品的分布不同。为了纠正这一点,我们重新审视了基于最大化关于可能的未来预测的预期信息的收购策略,参考这是预期的预测信息增益(EPIG)。由于EPIG对批量采集不扩展,我们进一步检查了替代策略,秃头和EPIG之间的混合,我们称之为联合预测信息增益(Jepig)。我们考虑在各种数据集中使用贝叶斯神经网络的主动学习,检查池集中分布班下的行为。
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大型观察数据越来越多地提供健康,经济和社会科学等学科,研究人员对因果问题而不是预测感兴趣。在本文中,从旨在调查参与学校膳食计划对健康指标的实证研究,研究了使用非参数回归的方法估算异质治疗效果的问题。首先,我们介绍了与观察或非完全随机数据进行因果推断相关的设置和相关的问题,以及如何在统计学习工具的帮助下解决这些问题。然后,我们审查并制定现有最先进的框架的统一分类,允许通过非参数回归模型来估算单个治疗效果。在介绍模型选择问题的简要概述后,我们说明了一些关于三种不同模拟研究的方法的性能。我们通过展示一些关于学校膳食计划数据的实证分析的一些方法的使用来结束。
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因果推断能够估计治疗效果(即,治疗结果的因果效果),使各个领域的决策受益。本研究中的一个基本挑战是观察数据的治疗偏见。为了提高对因果推断的观察研究的有效性,基于代表的方法作为最先进的方法表明了治疗效果估计的卓越性能。基于大多数基于表示的方法假设所有观察到的协变量都是预处理的(即,不受治疗影响的影响),并学习这些观察到的协变量的平衡表示,以估算治疗效果。不幸的是,这种假设往往在实践中往往是太严格的要求,因为一些协调因子是通过对治疗的干预进行改变(即,后治疗)来改变。相比之下,从不变的协变量中学到的平衡表示因此偏置治疗效果估计。
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在广泛的任务中,在包括医疗处理,广告和营销和政策制定的发​​展中,对观测数据进行因果推断非常有用。使用观察数据进行因果推断有两种重大挑战:治疗分配异质性(\ Texit {IE},治疗和未经处理的群体之间的差异),并且没有反事实数据(\ TEXTIT {IE},不知道是什么已经发生了,如果确实得到治疗的人,反而尚未得到治疗)。通过组合结构化推论和有针对性的学习来解决这两个挑战。在结构方面,我们将联合分布分解为风险,混淆,仪器和杂项因素,以及在目标学习方面,我们应用来自影响曲线的规则器,以减少残余偏差。进行了一项消融研究,对基准数据集进行评估表明,TVAE具有竞争力和最先进的艺术表现。
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由于数据有限和非识别性,观察性和介入数据的因果发现是具有挑战性的:在估计基本结构因果模型(SCM)时引入不确定性的因素。基于这两个因素引起的不确定性选择实验(干预措施)可以加快SCM的识别。来自有限数据的因果发现实验设计中的现有方法要么依赖于SCM的线性假设,要么仅选择干预目标。这项工作将贝叶斯因果发现的最新进展纳入了贝叶斯最佳实验设计框架中,从而使大型非线性SCM的积极因果发现同时选择了介入目标和值。我们证明了对线性和非线性SCM的合成图(ERDOS-R \'enyi,breetr cable)以及在\ emph {intiLico}单细胞基因调节网络数据集的\ emph {inyeare scms的性能。
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In many investigations, the primary outcome of interest is difficult or expensive to collect. Examples include long-term health effects of medical interventions, measurements requiring expensive testing or follow-up, and outcomes only measurable on small panels as in marketing. This reduces effective sample sizes for estimating the average treatment effect (ATE). However, there is often an abundance of observations on surrogate outcomes not of primary interest, such as short-term health effects or online-ad click-through. We study the role of such surrogate observations in the efficient estimation of treatment effects. To quantify their value, we derive the semiparametric efficiency bounds on ATE estimation with and without the presence of surrogates and several intermediary settings. The difference between these characterizes the efficiency gains from optimally leveraging surrogates. We study two regimes: when the number of surrogate observations is comparable to primary-outcome observations and when the former dominates the latter. We take an agnostic missing-data approach circumventing strong surrogate conditions previously assumed. To leverage surrogates' efficiency gains, we develop efficient ATE estimation and inference based on flexible machine-learning estimates of nuisance functions appearing in the influence functions we derive. We empirically demonstrate the gains by studying the long-term earnings effect of job training.
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Causal inference is the process of using assumptions, study designs, and estimation strategies to draw conclusions about the causal relationships between variables based on data. This allows researchers to better understand the underlying mechanisms at work in complex systems and make more informed decisions. In many settings, we may not fully observe all the confounders that affect both the treatment and outcome variables, complicating the estimation of causal effects. To address this problem, a growing literature in both causal inference and machine learning proposes to use Instrumental Variables (IV). This paper serves as the first effort to systematically and comprehensively introduce and discuss the IV methods and their applications in both causal inference and machine learning. First, we provide the formal definition of IVs and discuss the identification problem of IV regression methods under different assumptions. Second, we categorize the existing work on IV methods into three streams according to the focus on the proposed methods, including two-stage least squares with IVs, control function with IVs, and evaluation of IVs. For each stream, we present both the classical causal inference methods, and recent developments in the machine learning literature. Then, we introduce a variety of applications of IV methods in real-world scenarios and provide a summary of the available datasets and algorithms. Finally, we summarize the literature, discuss the open problems and suggest promising future research directions for IV methods and their applications. We also develop a toolkit of IVs methods reviewed in this survey at https://github.com/causal-machine-learning-lab/mliv.
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Although understanding and characterizing causal effects have become essential in observational studies, it is challenging when the confounders are high-dimensional. In this article, we develop a general framework $\textit{CausalEGM}$ for estimating causal effects by encoding generative modeling, which can be applied in both binary and continuous treatment settings. Under the potential outcome framework with unconfoundedness, we establish a bidirectional transformation between the high-dimensional confounders space and a low-dimensional latent space where the density is known (e.g., multivariate normal distribution). Through this, CausalEGM simultaneously decouples the dependencies of confounders on both treatment and outcome and maps the confounders to the low-dimensional latent space. By conditioning on the low-dimensional latent features, CausalEGM can estimate the causal effect for each individual or the average causal effect within a population. Our theoretical analysis shows that the excess risk for CausalEGM can be bounded through empirical process theory. Under an assumption on encoder-decoder networks, the consistency of the estimate can be guaranteed. In a series of experiments, CausalEGM demonstrates superior performance over existing methods for both binary and continuous treatments. Specifically, we find CausalEGM to be substantially more powerful than competing methods in the presence of large sample sizes and high dimensional confounders. The software of CausalEGM is freely available at https://github.com/SUwonglab/CausalEGM.
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传统的因果推理方法利用观察性研究数据来估计潜在治疗的观察到的差异和未观察到的结果,称为条件平均治疗效果(CATE)。然而,凯特就对应于仅第一刻的比较,因此可能不足以反映治疗效果的全部情况。作为替代方案,估计全部潜在结果分布可以提供更多的见解。但是,估计治疗效果的现有方法潜在的结果分布通常对这些分布施加限制性或简单的假设。在这里,我们提出了合作因果网络(CCN),这是一种新颖的方法,它通过学习全部潜在结果分布而超出了CATE的估计。通过CCN框架估算结果分布不需要对基础数据生成过程的限制性假设。此外,CCN促进了每种可能处理的效用的估计,并允许通过效用函数进行特定的特定变异。 CCN不仅将结果估计扩展到传统的风险差异之外,而且还可以通过定义灵活的比较来实现更全面的决策过程。根据因果文献中通常做出的假设,我们表明CCN学习了渐近捕获真正潜在结果分布的分布。此外,我们提出了一种调整方法,该方法在经验上可以有效地减轻观察数据中治疗组之间的样本失衡。最后,我们评估了CCN在多个合成和半合成实验中的性能。我们证明,与现有的贝叶斯和深层生成方法相比,CCN学会了改进的分布估计值,以及对各种效用功能的改进决策。
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随着时间的流逝,估计反事实结果有可能通过协助决策者回答“假设”问题来解锁个性化医疗保健。现有的因果推理方法通常考虑观察和治疗决策之间的定期离散时间间隔,因此无法自然地模拟不规则采样的数据,这是实践中的共同环境。为了处理任意观察模式,我们将数据解释为基础连续时间过程中的样本,并建议使用受控微分方程的数学明确地对其潜在轨迹进行建模。这导致了一种新方法,即治疗效果神经控制的微分方程(TE-CDE),该方程可在任何时间点评估潜在的结果。此外,对抗性训练用于调整时间依赖性混杂,这在纵向环境中至关重要,这是常规时间序列中未遇到的额外挑战。为了评估解决此问题的解决方案,我们提出了一个基于肿瘤生长模型的可控仿真环境,以反映出各种临床方案的一系列场景。在所有模拟场景中,TE-CDE始终优于现有方法,并具有不规则采样。
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We develop BatchBALD, a tractable approximation to the mutual information between a batch of points and model parameters, which we use as an acquisition function to select multiple informative points jointly for the task of deep Bayesian active learning. BatchBALD is a greedy linear-time 1 − 1 /e-approximate algorithm amenable to dynamic programming and efficient caching. We compare BatchBALD to the commonly used approach for batch data acquisition and find that the current approach acquires similar and redundant points, sometimes performing worse than randomly acquiring data. We finish by showing that, using BatchBALD to consider dependencies within an acquisition batch, we achieve new state of the art performance on standard benchmarks, providing substantial data efficiency improvements in batch acquisition.
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估计平均因果效应的理想回归(如果有)是什么?我们在离散协变量的设置中研究了这个问题,从而得出了各种分层估计器的有限样本方差的表达式。这种方法阐明了许多广泛引用的结果的基本统计现象。我们的博览会结合了研究因果效应估计的三种不同的方法论传统的见解:潜在结果,因果图和具有加性误差的结构模型。
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在制定政策指南时,随机对照试验(RCT)代表了黄金标准。但是,RCT通常是狭窄的,并且缺乏更广泛的感兴趣人群的数据。这些人群中的因果效应通常是使用观察数据集估算的,这可能会遭受未观察到的混杂和选择偏见。考虑到一组观察估计(例如,来自多项研究),我们提出了一个试图拒绝偏见的观察性估计值的元偏值。我们使用验证效应,可以从RCT和观察数据中推断出的因果效应。在拒绝未通过此测试的估计器之后,我们对RCT中未观察到的亚组的外推性效应产生了保守的置信区间。假设至少一个观察估计量在验证和外推效果方面是渐近正常且一致的,我们为我们算法输出的间隔的覆盖率概率提供了保证。为了促进在跨数据集的因果效应运输的设置中,我们给出的条件下,即使使用灵活的机器学习方法用于估计滋扰参数,群体平均治疗效应的双重稳定估计值也是渐近的正常。我们说明了方法在半合成和现实世界数据集上的特性,并表明它与标准的荟萃分析技术相比。
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观察数据中估算单个治疗效果(ITE)在许多领域,例如个性化医学等领域。但是,实际上,治疗分配通常被未观察到的变量混淆,因此引入了偏见。消除偏见的一种补救措施是使用仪器变量(IVS)。此类环境在医学中广泛存在(例如,将合规性用作二进制IV的试验)。在本文中,我们提出了一个新颖的,可靠的机器学习框架,称为MRIV,用于使用二进制IV估算ITES,从而产生无偏见的ITE估计器。与以前的二进制IV的工作不同,我们的框架通过伪结果回归直接估算了ITE。 (1)我们提供了一个理论分析,我们表明我们的框架产生了多重稳定的收敛速率:即使几个滋扰估计器的收敛缓慢,我们的ITE估计器也会达到快速收敛。 (2)我们进一步表明,我们的框架渐近地优于最先进的插件IV方法,以进行ITE估计。 (3)我们以理论结果为基础,并提出了一种使用二进制IVS的ITE估算的定制的,称为MRIV-NET的深度神经网络结构。在各种计算实验中,我们从经验上证明了我们的MRIV-NET实现最先进的性能。据我们所知,我们的MRIV是第一个机器学习框架,用于估算显示出倍增功能的二进制IV设置。
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Acquiring labeled data is challenging in many machine learning applications with limited budgets. Active learning gives a procedure to select the most informative data points and improve data efficiency by reducing the cost of labeling. The info-max learning principle maximizing mutual information such as BALD has been successful and widely adapted in various active learning applications. However, this pool-based specific objective inherently introduces a redundant selection and further requires a high computational cost for batch selection. In this paper, we design and propose a new uncertainty measure, Balanced Entropy Acquisition (BalEntAcq), which captures the information balance between the uncertainty of underlying softmax probability and the label variable. To do this, we approximate each marginal distribution by Beta distribution. Beta approximation enables us to formulate BalEntAcq as a ratio between an augmented entropy and the marginalized joint entropy. The closed-form expression of BalEntAcq facilitates parallelization by estimating two parameters in each marginal Beta distribution. BalEntAcq is a purely standalone measure without requiring any relational computations with other data points. Nevertheless, BalEntAcq captures a well-diversified selection near the decision boundary with a margin, unlike other existing uncertainty measures such as BALD, Entropy, or Mean Standard Deviation (MeanSD). Finally, we demonstrate that our balanced entropy learning principle with BalEntAcq consistently outperforms well-known linearly scalable active learning methods, including a recently proposed PowerBALD, a simple but diversified version of BALD, by showing experimental results obtained from MNIST, CIFAR-100, SVHN, and TinyImageNet datasets.
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决策者需要在采用新的治疗政策之前预测结果的发展,该政策定义了何时以及如何连续地影响结果的治疗序列。通常,预测介入的未来结果轨迹的算法将未来治疗的固定顺序作为输入。这要么忽略了未来治疗对结果之前的结果的依赖性,要么隐含地假设已知治疗政策,因此排除了该政策未知或需要反事实分析的情况。为了应对这些局限性,我们开发了一种用于治疗和结果的联合模型,该模型允许估计处理策略和顺序治疗(OUT COMECTION数据)的影响。它可以回答有关治疗政策干预措施的介入和反事实查询,因为我们使用有关血糖进展的现实数据显示,并在此基础上进行了模拟研究。
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因果推理的现有机器学习方法通​​常通过潜在结果平均值(例如平均治疗效应)估计数量。但是,此类数量不会捕获有关潜在结果分布的完整信息。在这项工作中,我们估计了观察数据干预后潜在结果的密度。具体而言,我们为此目的提出了一种新颖的,全参数的深度学习方法,称为介入归一化流。我们的介入归一化流提供了正确归一化的密度估计器。为此,我们介绍了两个正常流的迭代培训,即(i)教师流以估计令人讨厌的参数,以及(ii)学生流量,用于参数估计潜在结果的密度。为了对学生流参数的有效且双重稳定的估计,我们基于一步偏置校正开发了一个自定义的可拖动优化目标。在各种实验中,我们证明了我们的干预归一化流具有表达性和高效,并且可以很好地扩展样本量和高维混杂。据我们所知,我们的介入归一化流是第一种完全参数的深度学习方法,用于估计潜在结果。
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因果关系的概念在人类认知中起着重要作用。在过去的几十年中,在许多领域(例如计算机科学,医学,经济学和教育)中,因果推论已经得到很好的发展。随着深度学习技术的发展,它越来越多地用于针对反事实数据的因果推断。通常,深层因果模型将协变量的特征映射到表示空间,然后设计各种客观优化函数,以根据不同的优化方法公正地估算反事实数据。本文重点介绍了深层因果模型的调查,其核心贡献如下:1)我们在多种疗法和连续剂量治疗下提供相关指标; 2)我们从时间开发和方法分类的角度综合了深层因果模型的全面概述; 3)我们协助有关相关数据集和源代码的详细且全面的分类和分析。
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跨学科的一个重要问题是发现产生预期结果的干预措施。当可能的干预空间很大时,需要进行详尽的搜索,需要实验设计策略。在这种情况下,编码变量之间的因果关系以及因此对系统的影响,对于有效地确定理想的干预措施至关重要。我们开发了一种迭代因果方法来识别最佳干预措施,这是通过分布后平均值和所需目标平均值之间的差异来衡量的。我们制定了一种主动学习策略,该策略使用从不同干预措施中获得的样本来更新有关基本因果模型的信念,并确定对最佳干预措施最有用的样本,因此应在下一批中获得。该方法采用了因果模型的贝叶斯更新,并使用精心设计的,有因果关系的收购功能优先考虑干预措施。此采集函数以封闭形式进行评估,从而有效优化。理论上以信息理论界限和可证明的一致性结果在理论上基于理论上的算法。我们说明了综合数据和现实世界生物学数据的方法,即来自worturb-cite-seq实验的基因表达数据,以识别诱导特定细胞态过渡的最佳扰动;与几个基线相比,观察到所提出的因果方法可实现更好的样品效率。在这两种情况下,我们都认为因果知情的采集函数尤其优于现有标准,从而允许使用实验明显更少的最佳干预设计。
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