分配转移或培训数据和部署数据之间的不匹配是在高风险工业应用中使用机器学习的重要障碍,例如自动驾驶和医学。这需要能够评估ML模型的推广以及其不确定性估计的质量。标准ML基线数据集不允许评估这些属性,因为培训,验证和测试数据通常相同分布。最近,已经出现了一系列专用基准测试,其中包括分布匹配和转移的数据。在这些基准测试中,数据集在任务的多样性以及其功能的数据模式方面脱颖而出。虽然大多数基准测试由2D图像分类任务主导,但Shifts包含表格天气预测,机器翻译和车辆运动预测任务。这使得可以评估模型的鲁棒性属性,并可以得出多种工业规模的任务以及通用或直接适用的特定任务结论。在本文中,我们扩展了偏移数据集,其中两个数据集来自具有高社会重要性的工业高风险应用程序。具体而言,我们考虑了3D磁共振脑图像中白质多发性硬化病变的分割任务以及海洋货物容器中功耗的估计。两项任务均具有无处不在的分配变化和由于错误成本而构成严格的安全要求。这些新数据集将使研究人员能够进一步探索新情况下的强大概括和不确定性估计。在这项工作中,我们提供了两个任务的数据集和基线结果的描述。
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This paper focuses on the uncertainty estimation of white matter lesions (WML) segmentation in magnetic resonance imaging (MRI). On one side, voxel-scale segmentation errors cause the erroneous delineation of the lesions; on the other side, lesion-scale detection errors lead to wrong lesion counts. Both of these factors are clinically relevant for the assessment of multiple sclerosis patients. This work aims to compare the ability of different voxel- and lesion- scale uncertainty measures to capture errors related to segmentation and lesion detection respectively. Our main contributions are (i) proposing new measures of lesion-scale uncertainty that do not utilise voxel-scale uncertainties; (ii) extending an error retention curves analysis framework for evaluation of lesion-scale uncertainty measures. Our results obtained on the multi-center testing set of 58 patients demonstrate that the proposed lesion-scale measures achieves the best performance among the analysed measures. All code implementations are provided at https://github.com/NataliiaMolch/MS_WML_uncs
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多发性硬化症(MS)是中枢神经系统的慢性炎症和退行性疾病,其特征在于,白色和灰质的外观与个体患者的神经症状和标志进行地平整相关。磁共振成像(MRI)提供了详细的体内结构信息,允许定量和分类MS病变,其批判性地通知疾病管理。传统上,MS病变在2D MRI切片上手动注释,一个流程效率低,易于观察室内误差。最近,已经提出了自动统计成像分析技术以基于MRI体素强度检测和分段段病变。然而,它们的有效性受到MRI数据采集技术的异质性和MS病变的外观的限制。通过直接从图像学习复杂的病变表现,深度学习技术已经在MS病变分割任务中取得了显着的突破。在这里,我们提供了全面审查最先进的自动统计和深度学习MS分段方法,并讨论当前和未来的临床应用。此外,我们审查了域适应等技术策略,以增强现实世界临床环境中的MS病变分段。
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深度学习技术在检测医学图像中的对象方面取得了成功,但仍然遭受虚假阳性预测,可能会阻碍准确的诊断。神经网络输出的估计不确定性已用于标记不正确的预测。我们研究了来自神经网络不确定性估计的功能和基于形状的特征,这些特征是根据二进制预测计算出的,从二进制预测中,通过开发基于分类的后处理步骤来减少肝病病变检测中的假阳性,以用于不同的不确定性估计方法。我们证明了两个数据集上所有不确定性估计方法的神经网络的病变检测性能(相对于F1分数)的改善,分别包括腹部MR和CT图像。我们表明,根据神经网络不确定性估计计算的功能往往不会有助于降低假阳性。我们的结果表明,诸如阶级不平衡(真实假阳性比率)和从不确定性图提取的基于形状的特征之类的因素在区分假阳性和真实阳性预测方面起着重要作用
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最先进的语义或实例分割深度神经网络(DNN)通常在封闭的语义类上培训。因此,它们的装备不适用于处理以前的未持续的对象。然而,检测和定位这些物体对于安全关键应用至关重要,例如对自动驾驶的感知,特别是如果它们出现在前方的道路上。虽然某些方法已经解决了异常或分发的对象分割的任务,但由于缺乏固体基准,在很大程度上存在进展仍然缓慢;现有数据集由合成数据组成,或遭受标签不一致。在本文中,我们通过介绍“SegmentMeifyOUCAN”基准来弥合这个差距。我们的基准解决了两个任务:异常对象分割,这将考虑任何以前的未持续的对象类别;和道路障碍分割,它侧重于道路上的任何物体,可能是已知的或未知的。我们将两个相应的数据集与执行深入方法分析的测试套件一起提供,考虑到已建立的像素 - 明智的性能度量和最近的组件 - 明智的,这对对象尺寸不敏感。我们凭经验评估了多种最先进的基线方法,包括使用我们的测试套件在我们的数据集和公共数据上专门为异常/障碍分割而设计的多种型号。异常和障碍分割结果表明,我们的数据集有助于数据景观的多样性和难度。
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深度学习(DL)模型为各种医学成像基准挑战提供了最先进的性能,包括脑肿瘤细分(BRATS)挑战。然而,局灶性病理多隔室分割(例如,肿瘤和病变子区)的任务特别具有挑战性,并且潜在的错误阻碍DL模型转化为临床工作流程。量化不确定形式的DL模型预测的可靠性,可以实现最不确定的地区的临床审查,从而建立信任并铺平临床翻译。最近,已经引入了许多不确定性估计方法,用于DL医学图像分割任务。开发指标评估和比较不确定性措施的表现将有助于最终用户制定更明智的决策。在本研究中,我们探索并评估在Brats 2019-2020任务期间开发的公制,以对不确定量化量化(Qu-Brats),并旨在评估和排列脑肿瘤多隔室分割的不确定性估计。该公制(1)奖励不确定性估计,对正确断言产生高置信度,以及在不正确的断言处分配低置信水平的估计数,(2)惩罚导致更高百分比的无关正确断言百分比的不确定性措施。我们进一步基准测试由14个独立参与的Qu-Brats 2020的分割不确定性,所有这些都参与了主要的Brats细分任务。总体而言,我们的研究结果证实了不确定性估计提供了分割算法的重要性和互补价值,因此突出了医学图像分析中不确定性量化的需求。我们的评估代码在HTTPS://github.com/ragmeh11/qu-brats公开提供。
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Generalization is an important attribute of machine learning models, particularly for those that are to be deployed in a medical context, where unreliable predictions can have real world consequences. While the failure of models to generalize across datasets is typically attributed to a mismatch in the data distributions, performance gaps are often a consequence of biases in the 'ground-truth' label annotations. This is particularly important in the context of medical image segmentation of pathological structures (e.g. lesions), where the annotation process is much more subjective, and affected by a number underlying factors, including the annotation protocol, rater education/experience, and clinical aims, among others. In this paper, we show that modeling annotation biases, rather than ignoring them, poses a promising way of accounting for differences in annotation style across datasets. To this end, we propose a generalized conditioning framework to (1) learn and account for different annotation styles across multiple datasets using a single model, (2) identify similar annotation styles across different datasets in order to permit their effective aggregation, and (3) fine-tune a fully trained model to a new annotation style with just a few samples. Next, we present an image-conditioning approach to model annotation styles that correlate with specific image features, potentially enabling detection biases to be more easily identified.
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人工智能的最新趋势是将验证的模型用于语言和视觉任务,这些模型已经实现了非凡的表现,但也令人困惑。因此,以各种方式探索这些模型的能力对该领域至关重要。在本文中,我们探讨了模型的可靠性,在其中我们将可靠的模型定义为一个不仅可以实现强大的预测性能,而且在许多涉及不确定性(例如选择性预测,开放式设置识别)的决策任务上,在许多决策任务上表现出色,而且表现良好。强大的概括(例如,准确性和适当的评分规则,例如在分布数据集中和分发数据集上的对数可能性)和适应性(例如,主动学习,几乎没有射击不确定性)。我们设计了40个数据集的10种任务类型,以评估视觉和语言域上可靠性的不同方面。为了提高可靠性,我们分别开发了VIT-PLEX和T5-PLEX,分别针对视觉和语言方式扩展了大型模型。 PLEX极大地改善了跨可靠性任务的最先进,并简化了传统协议,因为它可以改善开箱即用的性能,并且不需要设计分数或为每个任务调整模型。我们演示了高达1B参数的模型尺寸的缩放效果,并预处理数据集大小最多4B示例。我们还展示了PLEX在具有挑战性的任务上的功能,包括零射门的开放式识别,主动学习和对话语言理解中的不确定性。
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机器学习(ML)系统的开发和部署可以用现代工具轻松执行,但该过程通常是匆忙和意思是结束的。缺乏勤奋会导致技术债务,范围蠕变和未对准的目标,模型滥用和失败,以及昂贵的后果。另一方面,工程系统遵循明确定义的流程和测试标准,以简化高质量,可靠的结果的开发。极端是航天器系统,其中关键任务措施和鲁棒性在开发过程中根深蒂固。借鉴航天器工程和ML的经验(通过域名通过产品的研究),我们开发了一种经过验证的机器学习开发和部署的系统工程方法。我们的“机器学习技术准备水平”(MLTRL)框架定义了一个原则的过程,以确保强大,可靠和负责的系统,同时为ML工作流程流线型,包括来自传统软件工程的关键区别。 MLTRL甚至更多,MLTRL为跨团队和组织的人们定义了一个人工智能和机器学习技术的人员。在这里,我们描述了通过生产化和部署在医学诊断,消费者计算机视觉,卫星图像和粒子物理学等领域,以通过生产和部署在基本研究中开发ML方法的几个现实世界使用情况的框架和阐明。
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信号处理是几乎任何传感器系统的基本组件,具有不同科学学科的广泛应用。时间序列数据,图像和视频序列包括可以增强和分析信息提取和量化的代表性形式的信号。人工智能和机器学习的最近进步正在转向智能,数据驱动,信号处理的研究。该路线图呈现了最先进的方法和应用程序的关键概述,旨在突出未来的挑战和对下一代测量系统的研究机会。它涵盖了广泛的主题,从基础到工业研究,以简明的主题部分组织,反映了每个研究领域的当前和未来发展的趋势和影响。此外,它为研究人员和资助机构提供了识别新前景的指导。
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脑小血管疾病的成像标记提供了有关脑部健康的宝贵信息,但是它们的手动评估既耗时又受到实质性内部和间际变异性的阻碍。自动化评级可能受益于生物医学研究以及临床评估,但是现有算法的诊断可靠性尚不清楚。在这里,我们介绍了\ textIt {血管病变检测和分割}(\ textit {v textit {where valdo?})挑战,该挑战是在国际医学图像计算和计算机辅助干预措施(MICCAI)的卫星事件中运行的挑战(MICCAI) 2021.这一挑战旨在促进大脑小血管疾病的小而稀疏成像标记的自动检测和分割方法的开发,即周围空间扩大(EPVS)(任务1),脑微粒(任务2)和预先塑造的鞋类血管起源(任务3),同时利用弱和嘈杂的标签。总体而言,有12个团队参与了针对一个或多个任务的解决方案的挑战(任务1 -EPVS 4,任务2 -Microbleeds的9个,任务3 -lacunes的6个)。多方数据都用于培训和评估。结果表明,整个团队和跨任务的性能都有很大的差异,对于任务1- EPV和任务2-微型微型且对任务3 -lacunes尚无实际的结果,其结果尤其有望。它还强调了可能阻止个人级别使用的情况的性能不一致,同时仍证明在人群层面上有用。
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超参数优化构成了典型的现代机器学习工作流程的很大一部分。这是由于这样一个事实,即机器学习方法和相应的预处理步骤通常只有在正确调整超参数时就会产生最佳性能。但是在许多应用中,我们不仅有兴趣仅仅为了预测精度而优化ML管道;确定最佳配置时,必须考虑其他指标或约束,从而导致多目标优化问题。由于缺乏知识和用于多目标超参数优化的知识和容易获得的软件实现,因此通常在实践中被忽略。在这项工作中,我们向读者介绍了多个客观超参数优化的基础知识,并激励其在应用ML中的实用性。此外,我们从进化算法和贝叶斯优化的领域提供了现有优化策略的广泛调查。我们说明了MOO在几个特定ML应用中的实用性,考虑了诸如操作条件,预测时间,稀疏,公平,可解释性和鲁棒性之类的目标。
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背景信息:在过去几年中,机器学习(ML)一直是许多创新的核心。然而,包括在所谓的“安全关键”系统中,例如汽车或航空的系统已经被证明是非常具有挑战性的,因为ML的范式转变为ML带来完全改变传统认证方法。目的:本文旨在阐明与ML为基础的安全关键系统认证有关的挑战,以及文献中提出的解决方案,以解决它们,回答问题的问题如何证明基于机器学习的安全关键系统?'方法:我们开展2015年至2020年至2020年之间发布的研究论文的系统文献综述(SLR),涵盖了与ML系统认证有关的主题。总共确定了217篇论文涵盖了主题,被认为是ML认证的主要支柱:鲁棒性,不确定性,解释性,验证,安全强化学习和直接认证。我们分析了每个子场的主要趋势和问题,并提取了提取的论文的总结。结果:单反结果突出了社区对该主题的热情,以及在数据集和模型类型方面缺乏多样性。它还强调需要进一步发展学术界和行业之间的联系,以加深域名研究。最后,它还说明了必须在上面提到的主要支柱之间建立连接的必要性,这些主要柱主要主要研究。结论:我们强调了目前部署的努力,以实现ML基于ML的软件系统,并讨论了一些未来的研究方向。
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如今,人工智能(AI)已成为临床和远程医疗保健应用程序的基本组成部分,但是最佳性能的AI系统通常太复杂了,无法自我解释。可解释的AI(XAI)技术被定义为揭示系统的预测和决策背后的推理,并且在处理敏感和个人健康数据时,它们变得更加至关重要。值得注意的是,XAI并未在不同的研究领域和数据类型中引起相同的关注,尤其是在医疗保健领域。特别是,许多临床和远程健康应用程序分别基于表格和时间序列数据,而XAI并未在这些数据类型上进行分析,而计算机视觉和自然语言处理(NLP)是参考应用程序。为了提供最适合医疗领域表格和时间序列数据的XAI方法的概述,本文提供了过去5年中文献的审查,说明了生成的解释的类型以及为评估其相关性所提供的努力和质量。具体而言,我们确定临床验证,一致性评估,客观和标准化质量评估以及以人为本的质量评估作为确保最终用户有效解释的关键特征。最后,我们强调了该领域的主要研究挑战以及现有XAI方法的局限性。
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机器学习和计算机视觉技术近年来由于其自动化,适合性和产生惊人结果的能力而迅速发展。因此,在本文中,我们调查了2014年至2022年之间发表的关键研究,展示了不同的机器学习算法研究人员用来分割肝脏,肝肿瘤和肝脉管结构的研究。我们根据感兴趣的组织(肝果,肝肿瘤或肝毒剂)对被调查的研究进行了划分,强调了同时解决多个任务的研究。此外,机器学习算法被归类为受监督或无监督的,如果属于某个方案的工作量很大,则将进一步分区。此外,对文献和包含上述组织面具的网站发现的不同数据集和挑战进行了彻底讨论,强调了组织者的原始贡献和其他研究人员的贡献。同样,在我们的评论中提到了文献中过度使用的指标,这强调了它们与手头的任务的相关性。最后,强调创新研究人员应对需要解决的差距的关键挑战和未来的方向,例如许多关于船舶分割挑战的研究的稀缺性以及为什么需要早日处理他们的缺席。
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眼睛的临床诊断是对多种数据模式进行的,包括标量临床标签,矢量化生物标志物,二维底面图像和三维光学相干性层析成像(OCT)扫描。临床从业者使用所有可用的数据模式来诊断和治疗糖尿病性视网膜病(DR)或糖尿病黄斑水肿(DME)等眼部疾病。在眼科医学领域启用机器学习算法的使用需要研究治疗期内所有相关数据之间的关系和相互作用。现有的数据集受到限制,因为它们既不提供数据,也没有考虑数据模式之间的显式关系建模。在本文中,我们介绍了用于研究以上限制的视觉眼睛语义(橄榄)数据集的眼科标签。这是第一个OCT和近IIR眼底数据集,其中包括临床标签,生物标记标签,疾病标签和时间序列的患者治疗信息,来自相关临床试验。该数据集由1268个近红外图像组成,每个图像至少具有49个10月扫描和16个生物标志物,以及4个临床标签和DR或DME的疾病诊断。总共有96张眼睛的数据在至少两年的时间内平均,每只眼睛平均治疗66周和7次注射。我们在医学图像分析中为橄榄数据集进行了橄榄数据集的实用性,并为核心和新兴机器学习范式提供了基准和具体研究方向。
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COVID-19的大流行提出了对多个领域决策者的流行预测的重要性,从公共卫生到整个经济。虽然预测流行进展经常被概念化为类似于天气预测,但是它具有一些关键的差异,并且仍然是一项非平凡的任务。疾病的传播受到人类行为,病原体动态,天气和环境条件的多种混杂因素的影响。由于政府公共卫生和资助机构的倡议,捕获以前无法观察到的方面的丰富数据来源的可用性增加了研究的兴趣。这尤其是在“以数据为中心”的解决方案上进行的一系列工作,这些解决方案通过利用非传统数据源以及AI和机器学习的最新创新来增强我们的预测能力的潜力。这项调查研究了各种数据驱动的方法论和实践进步,并介绍了一个概念框架来导航它们。首先,我们列举了与流行病预测相关的大量流行病学数据集和新的数据流,捕获了各种因素,例如有症状的在线调查,零售和商业,流动性,基因组学数据等。接下来,我们将讨论关注最近基于数据驱动的统计和深度学习方法的方法和建模范式,以及将机械模型知识域知识与统计方法的有效性和灵活性相结合的新型混合模型类别。我们还讨论了这些预测系统的现实部署中出现的经验和挑战,包括预测信息。最后,我们重点介绍了整个预测管道中发现的一些挑战和开放问题。
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作为行业4.0时代的一项新兴技术,数字双胞胎因其承诺进一步优化流程设计,质量控制,健康监测,决策和政策制定等,通过全面对物理世界进行建模,以进一步优化流程设计,质量控制,健康监测,决策和政策,因此获得了前所未有的关注。互连的数字模型。在一系列两部分的论文中,我们研究了不同建模技术,孪生启用技术以及数字双胞胎常用的不确定性量化和优化方法的基本作用。第二篇论文介绍了数字双胞胎的关键启示技术的文献综述,重点是不确定性量化,优化方法,开源数据集和工具,主要发现,挑战和未来方向。讨论的重点是当前的不确定性量化和优化方法,以及如何在数字双胞胎的不同维度中应用它们。此外,本文介绍了一个案例研究,其中构建和测试了电池数字双胞胎,以说明在这两部分评论中回顾的一些建模和孪生方法。 GITHUB上可以找到用于生成案例研究中所有结果和数字的代码和预处理数据。
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最近实现了更准确的短期预测的数据驱动的空气质量预测。尽管取得了成功,但大多数目前的数据驱动解决方案都缺乏适当的模型不确定性的量化,以传达信任预测的程度。最近,在概率深度学习中已经制定了几种估计不确定性的实用工具。但是,在空气质量预测领域的域中没有经验应用和广泛的比较这些工具。因此,这项工作在空气质量预测的真实环境中应用了最先进的不确定性量化。通过广泛的实验,我们描述了培训概率模型,并根据经验性能,信心可靠性,置信度估计和实际适用性评估其预测性不确定性。我们还使用空气质量数据中固有的“自由”对抗培训和利用时间和空间相关性提出改善这些模型。我们的实验表明,所提出的模型比以前的工作更好地在量化数据驱动空气质量预测中的不确定性方面表现出。总体而言,贝叶斯神经网络提供了更可靠的不确定性估计,但可能挑战实施和规模。其他可扩展方法,如深合奏,蒙特卡罗(MC)辍学和随机重量平均-Gaussian(SWAG)可以执行良好,如果正确应用,但具有不同的权衡和性能度量的轻微变化。最后,我们的结果表明了不确定性估计的实际影响,并证明了,实际上,概率模型更适合提出知情决策。代码和数据集可用于\ url {https:/github.com/abdulmajid-murad/deep_probabilistic_forecast}
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While there have been a number of remarkable breakthroughs in machine learning (ML), much of the focus has been placed on model development. However, to truly realize the potential of machine learning in real-world settings, additional aspects must be considered across the ML pipeline. Data-centric AI is emerging as a unifying paradigm that could enable such reliable end-to-end pipelines. However, this remains a nascent area with no standardized framework to guide practitioners to the necessary data-centric considerations or to communicate the design of data-centric driven ML systems. To address this gap, we propose DC-Check, an actionable checklist-style framework to elicit data-centric considerations at different stages of the ML pipeline: Data, Training, Testing, and Deployment. This data-centric lens on development aims to promote thoughtfulness and transparency prior to system development. Additionally, we highlight specific data-centric AI challenges and research opportunities. DC-Check is aimed at both practitioners and researchers to guide day-to-day development. As such, to easily engage with and use DC-Check and associated resources, we provide a DC-Check companion website (https://www.vanderschaar-lab.com/dc-check/). The website will also serve as an updated resource as methods and tooling evolve over time.
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