在这项工作中，我们开发了一种新的方法，名为局部排列的图形神经网络，它为建立在本地节点邻域，通过子图形的构建图形神经网络的框架，同时使用置换等值更新功能。消息传递神经网络的消息被认为是有效应功率的限制，并且最近过度的方法缺乏可扩展性或需要将结构信息被编码为特征空间。这里呈现的一般框架克服了通过通过受限制表示在子图上操作的与全局排列等值相关的可扩展性问题。此外，我们证明了通过使用限制的陈述没有丧失表情。此外，所提出的框架仅需要选择$ k $-hops，用于创建用于为每层使用的子图和选择的表示空间，这使得该方法在一系列基于图形的域中可以容易地适用。我们通过实验验证了一系列图形基准分类任务的方法，在所有基准上展示了最先进的结果或非常竞争力的结果。此外，我们证明使用本地更新函数的使用在全球方法上提供了GPU存储器的显着改进。
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消息传递神经网络（MPNNS）是由于其简单性和可扩展性而大部分地进行图形结构数据的深度学习的领先架构。不幸的是，有人认为这些架构的表现力有限。本文提出了一种名为Comifariant Subgraph聚合网络（ESAN）的新颖框架来解决这个问题。我们的主要观察是，虽然两个图可能无法通过MPNN可区分，但它们通常包含可区分的子图。因此，我们建议将每个图形作为由某些预定义策略导出的一组子图，并使用合适的等分性架构来处理它。我们为图同构同构同构造的1立维Weisfeiler-Leman（1-WL）测试的新型变体，并在这些新的WL变体方面证明了ESAN的表达性下限。我们进一步证明，我们的方法增加了MPNNS和更具表现力的架构的表现力。此外，我们提供了理论结果，描述了设计选择诸如子图选择政策和等效性神经结构的设计方式如何影响我们的架构的表现力。要处理增加的计算成本，我们提出了一种子图采样方案，可以将其视为我们框架的随机版本。关于真实和合成数据集的一套全面的实验表明，我们的框架提高了流行的GNN架构的表现力和整体性能。
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子图GNNS是最近表达的图形神经网络（GNN）的一类，它们将图形图形为子图的集合。到目前为止，可能的子图GNN体系结构的设计空间及其基本理论属性仍然在很大程度上尚未探索。在本文中，我们研究了子图方法的最突出形式，该方法采用了基于节点的子图选择策略，例如自我网络或节点标记和删除。我们解决了两个中心问题：（1）这些方法的表达能力的上限是什么？ （2）在这些子图集上传递层的模棱两可的消息家族是什么？我们回答这些问题的第一步是一种新颖的对称分析，该分析表明，建模基于节点的子图集的对称性需要比以前的作品中所采用的对称组明显小。然后，该分析用于建立子图GNN和不变图网络（IGNS）之间的联系。我们通过首先通过3-WL来界定子图方法的表达能力，然后提出一个通用子图方法的一般家族，以将所有先前基于节点的子图GNN泛化。最后，我们设计了一个新颖的子图Gnn称为Sun，从理论上讲，该子gnn统一了以前的体系结构，同时在多个基准上提供了更好的经验性能。
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近年来，基于Weisfeiler-Leman算法的算法和神经架构，是一个众所周知的Graph同构问题的启发式问题，它成为具有图形和关系数据的机器学习的强大工具。在这里，我们全面概述了机器学习设置中的算法的使用，专注于监督的制度。我们讨论了理论背景，展示了如何将其用于监督的图形和节点表示学习，讨论最近的扩展，并概述算法的连接（置换 - ）方面的神经结构。此外，我们概述了当前的应用和未来方向，以刺激进一步的研究。
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图形神经网络（GNNS）的表现力量受到限制，具有远程交互的斗争，缺乏模拟高阶结构的原则性方法。这些问题可以归因于计算图表和输入图结构之间的强耦合。最近提出的消息通过单独的网络通过执行图形的Clique复合物的消息来自然地解耦这些元素。然而，这些模型可能受到单纯复合物（SCS）的刚性组合结构的严重限制。在这项工作中，我们将最近的基于常规细胞复合物的理论结果扩展到常规细胞复合物，灵活地满满SCS和图表的拓扑物体。我们表明，该概括提供了一组强大的图表“提升”转换，每个图形是导致唯一的分层消息传递过程。我们集体呼叫CW Networks（CWNS）的结果方法比WL测试更强大，而不是比3 WL测试更强大。特别是，当应用于分子图问题时，我们证明了一种基于环的一个这样的方案的有效性。所提出的架构从可提供的较大的表达效益于常用的GNN，高阶信号的原则建模以及压缩节点之间的距离。我们展示了我们的模型在各种分子数据集上实现了最先进的结果。
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Identifying similar network structures is key to capture graph isomorphisms and learn representations that exploit structural information encoded in graph data. This work shows that ego-networks can produce a structural encoding scheme for arbitrary graphs with greater expressivity than the Weisfeiler-Lehman (1-WL) test. We introduce IGEL, a preprocessing step to produce features that augment node representations by encoding ego-networks into sparse vectors that enrich Message Passing (MP) Graph Neural Networks (GNNs) beyond 1-WL expressivity. We describe formally the relation between IGEL and 1-WL, and characterize its expressive power and limitations. Experiments show that IGEL matches the empirical expressivity of state-of-the-art methods on isomorphism detection while improving performance on seven GNN architectures.
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最近出现了许多子图增强图神经网络（GNN），可证明增强了标准（消息通话）GNN的表达能力。但是，对这些方法之间的相互关系和weisfeiler层次结构的关系有限。此外，当前的方法要么使用给定尺寸的所有子图，要随机均匀地对其进行采样，或者使用手工制作的启发式方法，而不是学习以数据驱动的方式选择子图。在这里，我们提供了一种统一的方法来研究此类体系结构，通过引入理论框架并扩展了亚图增强GNN的已知表达结果。具体而言，我们表明，增加子图的大小总是会增加表达能力，并通过将它们与已建立的$ k \ text { - } \ Mathsf {Wl} $ hierArchy联系起来，从而更好地理解其局限性。此外，我们还使用最近通过复杂的离散概率分布进行反向传播的方法探索了学习对子图进行采样的不同方法。从经验上讲，我们研究了不同子图增强的GNN的预测性能，表明我们的数据驱动体系结构与非DATA驱动的亚图增强图形神经网络相比，在标准基准数据集上提高了对标准基准数据集的预测准确性，同时减少了计算时间。
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在本文中，我们提供了一种使用图形神经网络（GNNS）的理论，用于多节点表示学习（我们有兴趣学习一组多个节点的表示）。我们知道GNN旨在学习单节点表示。当我们想学习涉及多个节点的节点集表示时，先前作品中的常见做法是直接将GNN学习的多节点表示与节点集的关节表示。在本文中，我们显示了这种方法的基本限制，即无法捕获节点集中节点之间的依赖性，并且认为直接聚合各个节点表示不会导致多个节点的有效关节表示。然后，我们注意到，以前的一些成功的工作作品用于多节点表示学习，包括密封，距离编码和ID-GNN，所有使用的节点标记。这些方法根据应用GNN之前的与目标节点集的关系，首先标记图中的节点。然后，在标记的图表中获得的节点表示被聚合到节点集表示中。通过调查其内部机制，我们将这些节点标记技术统一到单个和最基本的形式，即标记技巧。我们证明，通过标记技巧，可以获得足够富有表现力的GNN学习最具表现力的节点集表示，因此原则上可以解决节点集的任何联合学习任务。关于一个重要的双节点表示学习任务，链接预测，验证了我们理论的实验。我们的工作建立了使用GNN在节点集上使用GNN进行联合预测任务的理论基础。
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2022-03-25
尽管（消息通话）图形神经网络在图形或一般关系数据上近似置换量等函数方面具有明显的局限性，但更具表现力的高阶图神经网络不会扩展到大图。他们要么在$ k $ - 订单张量子上操作，要么考虑所有$ k $ - 节点子图，这意味着在内存需求中对$ k $的指数依赖，并且不适合图形的稀疏性。通过为图同构问题引入新的启发式方法，我们设计了一类通用的，置换式的图形网络，与以前的体系结构不同，该网络在表达性和可伸缩性之间提供了细粒度的控制，并适应了图的稀疏性。这些体系结构与监督节点和图形级别的标准高阶网络以及回归体系中的标准高阶图网络相比大大减少了计算时间，同时在预测性能方面显着改善了标准图神经网络和图形内核体系结构。
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Pre-publication draft of a book to be published byMorgan & Claypool publishers. Unedited version released with permission. All relevant copyrights held by the author and publisher extend to this pre-publication draft.
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图形神经网络（GNNS）最流行的设计范例是1跳消息传递 - 反复反复从1跳邻居聚集特征。但是，1-HOP消息传递的表达能力受Weisfeiler-Lehman（1-WL）测试的界定。最近，研究人员通过同时从节点的K-Hop邻居汇总信息传递到K-HOP消息。但是，尚无分析K-Hop消息传递的表达能力的工作。在这项工作中，我们从理论上表征了K-Hop消息传递的表达力。具体而言，我们首先正式区分了两种k-hop消息传递的内核，它们在以前的作品中经常被滥用。然后，我们通过表明它比1-Hop消息传递更强大，从而表征了K-Hop消息传递的表现力。尽管具有较高的表达能力，但我们表明K-Hop消息传递仍然无法区分一些简单的常规图。为了进一步增强其表现力，我们引入了KP-GNN框架，该框架通过利用每个跳跃中的外围子图信息来改善K-HOP消息。我们证明，KP-GNN可以区分几乎所有常规图，包括一些距离常规图，这些图无法通过以前的距离编码方法来区分。实验结果验证了KP-GNN的表达能力和有效性。 KP-GNN在所有基准数据集中都取得了竞争成果。
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我们研究了图形表示学习的量子电路，并提出了等级的量子图电路（EQGCS），作为一类参数化量子电路，具有强大的关系感应偏压，用于学习图形结构数据。概念上，EQGCS作为量子图表表示学习的统一框架，允许我们定义几个有趣的子类，其中包含了现有的提案。就代表性权力而言，我们证明了感兴趣的子类是界限图域中的函数的普遍近似器，并提供实验证据。我们对量子图机学习方法的理论透视开启了许多方向以进行进一步的工作，可能导致具有超出古典方法的能力的模型。
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计算机视觉和机器学习中的许多问题都可以作为代表高阶关系的超图的学习。 HyperGraph Learning的最新方法基于消息传递扩展了图形神经网络，这在建模远程依赖性和表达能力方面很简单但根本上有限。另一方面，基于张量的模棱两可的神经网络具有最大的表现力，但是由于沉重的计算和对固定顺序超中件的严格假设，它们的应用受到了超图的限制。我们解决了这些问题，并目前呈现了模棱两可的HyperGraph神经网络（EHNN），这是实现一般超图学习最大表达性的层的首次尝试。我们还提出了基于超网（EHNN-MLP）和自我注意力（EHNN-TransFormer）的两个实用实现，这些实现易于实施，理论上比大多数消息传递方法更具表现力。我们证明了它们在一系列超图学习问题中的能力，包括合成K边缘识别，半监督分类和视觉关键点匹配，并报告对强烈消息传递基线的改进性能。我们的实施可从https://github.com/jw9730/ehnn获得。
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消息传递神经网络（MPNNs）是格拉夫神经网络（GNN）的一个常见的类型，其中，每个节点的表示是通过聚集从表示其直接邻居（消息）类似于一个星形图案递归计算。 MPNNs的呼吁是有效的，可扩展的，怎么样，曾经它们的表现是由一阶Weisfeiler雷曼同构测试（1-WL）的上界。对此，之前的作品提出在可扩展性的成本极富表现力的模型，有时泛化性能。我们的工作表示这两个政权：我们介绍抬升任何MPNN更加传神，具有可扩展性有限的开销，大大提高了实用性能的总体框架。我们从星星图案一般的子模式（例如，K-egonets）在MPNNs扩展本地聚合实现这一点：在我们的框架中，每个节点表示被计算为周边诱发子的编码，而不是唯一的近邻编码（即一个明星）。我们选择子编码器是一个GNN（主要是MPNNs，考虑到可扩展性）来设计用作一个包装掀任何GNN的总体框架。我们把我们提出的方法GNN-AK（GNN为核心），作为框架用GNNS更换内核类似于卷积神经网络。从理论上讲，我们表明，我们的框架比1和2-WL确实更强大，并且不超过3-WL那么强大。我们还设计子取样策略，可大大降低内存占用和提高速度的同时保持性能。我们的方法将大利润率多家知名图形ML任务新的国家的最先进的性能;具体地，0.08 MAE锌，74.79％和86.887％的准确度上CIFAR10和分别PATTERN。
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本文研究了辍学图神经网络（DAVERGNNS），一种旨在克服标准GNN框架的局限性的新方法。在DAMPGNNS中，我们在输入图上执行多个GNN运行，其中一些节点随机且独立地在这些运行中丢弃。然后，我们将这些运行的结果结合起来获得最终结果。我们证明DAMPGNN可以区分无法通过GNN的消息分隔的各种图形邻域。我们导出了确保可靠分布辍学所需的运行数量的理论界限，我们证明了有关DACKGNNS的表现能力和限制的若干特性。我们在实验上验证了我们对表现力的理论结果。此外，我们表明DOWNNNS在已建立的GNN基准上表现得很竞争。
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在过去十年中，图形内核引起了很多关注，并在结构化数据上发展成为一种快速发展的学习分支。在过去的20年中，该领域发生的相当大的研究活动导致开发数十个图形内核，每个图形内核都对焦于图形的特定结构性质。图形内核已成功地成功地在广泛的域中，从社交网络到生物信息学。本调查的目标是提供图形内核的文献的统一视图。特别是，我们概述了各种图形内核。此外，我们对公共数据集的几个内核进行了实验评估，并提供了比较研究。最后，我们讨论图形内核的关键应用，并概述了一些仍有待解决的挑战。
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我们表明，没有图形特异性修改的标准变压器可以在理论和实践中都带来图形学习的有希望的结果。鉴于图，我们只是将所有节点和边缘视为独立的令牌，用令牌嵌入增强它们，然后将它们馈入变压器。有了适当的令牌嵌入选择，我们证明这种方法在理论上至少与不变的图形网络（2-ign）一样表达，由等效线性层组成，它已经比所有消息传播的图形神经网络（GNN）更具表现力）。当在大规模图数据集（PCQM4MV2）上接受训练时，与具有精致的图形特异性电感偏置相比，与GNN基准相比，与GNN基准相比，与GNN基准相比，与GNN基准相比，我们创造的令牌化图形变压器（Tokengt）取得了明显更好的结果。我们的实施可从https://github.com/jw9730/tokengt获得。
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Graph神经网络（GNN）最近已成为使用图的机器学习的主要范式。对GNNS的研究主要集中于消息传递神经网络（MPNNS）的家族。与同构的Weisfeiler-Leman（WL）测试类似，这些模型遵循迭代的邻域聚合过程以更新顶点表示，并通过汇总顶点表示来更新顶点图表。尽管非常成功，但在过去的几年中，对MPNN进行了深入的研究。因此，需要新颖的体系结构，这将使该领域的研究能够脱离MPNN。在本文中，我们提出了一个新的图形神经网络模型，即所谓的$ \ pi $ -gnn，该模型学习了每个图的“软”排列（即双随机）矩阵，从而将所有图形投影到一个共同的矢量空间中。学到的矩阵在输入图的顶点上强加了“软”顺序，并基于此顺序，将邻接矩阵映射到向量中。这些向量可以被送入完全连接或卷积的层，以应对监督的学习任务。在大图的情况下，为了使模型在运行时间和记忆方面更有效，我们进一步放松了双随机矩阵，以使其排列随机矩阵。我们从经验上评估了图形分类和图形回归数据集的模型，并表明它与最新模型达到了性能竞争。
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我们提出了一个新的图形神经网络，我们称为AgentNet，该网络专为图形级任务而设计。 AgentNet的灵感来自子宫性算法，具有独立于图形大小的计算复杂性。代理Net的体系结构从根本上与已知图神经网络的体系结构不同。在AgentNet中，一些受过训练的\ textit {神经代理}智能地行走图，然后共同决定输出。我们提供了对AgentNet的广泛理论分析：我们表明，代理可以学会系统地探索其邻居，并且AgentNet可以区分某些甚至3-WL无法区分的结构。此外，AgentNet能够将任何两个图形分开，这些图在子图方面完全不同。我们通过在难以辨认的图和现实图形分类任务上进行合成实验来确认这些理论结果。在这两种情况下，我们不仅与标准GNN相比，而且与计算更昂贵的GNN扩展相比。
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图形内核是历史上最广泛使用的图形分类任务的技术。然而，由于图的手工制作的组合特征，这些方法具有有限的性能。近年来，由于其性能卓越，图形神经网络（GNNS）已成为与下游图形相关任务的最先进的方法。大多数GNN基于消息传递神经网络（MPNN）框架。然而，最近的研究表明，MPNN不能超过Weisfeiler-Lehman（WL）算法在图形同构术中的力量。为了解决现有图形内核和GNN方法的限制，在本文中，我们提出了一种新的GNN框架，称为\ Texit {内核图形神经网络}（Kernnns），该框架将图形内核集成到GNN的消息传递过程中。通过卷积神经网络（CNNS）中的卷积滤波器的启发，KERGNNS采用可训练的隐藏图作为绘图过滤器，该绘图过滤器与子图组合以使用图形内核更新节点嵌入式。此外，我们表明MPNN可以被视为Kergnns的特殊情况。我们将Kergnns应用于多个与图形相关的任务，并使用交叉验证来与基准进行公平比较。我们表明，与现有的现有方法相比，我们的方法达到了竞争性能，证明了增加GNN的表现能力的可能性。我们还表明，KERGNNS中的训练有素的图形过滤器可以揭示数据集的本地图形结构，与传统GNN模型相比，显着提高了模型解释性。
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