光声(OA)成像基于对生物组织的激发,该组织具有纳米持续激光脉冲,然后随后检测通过光吸收介导的热弹性扩张产生的超声波。 OA成像具有丰富的光学对比度和深层组织高分辨率之间的强大组合。这使得在临床和实验室环境中都可以探索许多有吸引力的新应用程序。但是,没有使用不同类型的实验设置和相关处理方法生成的标准化数据集,可以促进OA在临床环境中的更广泛应用中的进步。这使新的和已建立的数据处理方法之间的客观比较变得复杂,通常会导致定性结果和对数据的任意解释。在本文中,我们提供实验性和合成OA原始信号以及带有不同实验参数和层析成像采集几何形状的重建图像结构域数据集。我们进一步提供了训练有素的神经网络,以应对与OA图像处理相关的三个重要挑战,即在有限的视图层析成像条件下准确重建,去除空间不足的采样伪像以及解剖学细分,以改善图像重建。具体而言,我们将与上述挑战相对应的18个实验定义为用于开发更先进处理方法的参考的基准。
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信号处理是几乎任何传感器系统的基本组件,具有不同科学学科的广泛应用。时间序列数据,图像和视频序列包括可以增强和分析信息提取和量化的代表性形式的信号。人工智能和机器学习的最近进步正在转向智能,数据驱动,信号处理的研究。该路线图呈现了最先进的方法和应用程序的关键概述,旨在突出未来的挑战和对下一代测量系统的研究机会。它涵盖了广泛的主题,从基础到工业研究,以简明的主题部分组织,反映了每个研究领域的当前和未来发展的趋势和影响。此外,它为研究人员和资助机构提供了识别新前景的指导。
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基于模型的经颅超声疗法的治疗计划通常涉及从头部的X射线计算机断层扫描(CT)图像中映射头骨的声学特性。在这里,将三种用于从磁共振(MR)图像中生成伪CT图像的方法作为CT的替代方法。在配对的MR-CT图像上训练了卷积神经网络(U-NET),以从T1加权或零回波时间(ZTE)MR图像(分别表示TCT和ZCT)生成伪CT图像。还实施了从中兴通讯到伪CT的直接映射(表示为CCT)。在比较测试集的伪CT和地面真相CT图像时,整个头部的平均绝对误差为133、83和145 Hounsfield单位(HU),以及398、222和336 HU的头骨内的颅骨内部的平均误差为133、83和145个。 TCT,ZCT和CCT图像。还使用生成的伪CT图像进行了超声模拟,并将其与基于CT的模拟进行了比较。使用环形阵列传感器针对视觉或运动皮层。基于TCT图像的模拟,模拟局灶性局灶性,焦点位置和焦距的平均差异为9.9%,1.5 mm和15.1%,ZCT的平均差异为5.7%,0.6 mm和5.7%,为6.7%,和5.7% CCT为0.9毫米,为12.1%。映射的图像的改进结果突出了使用成像序列的优势,从而改善了颅骨的对比度。总体而言,这些结果表明,基于MR图像的声学仿真可以与基于CT的声学相比精度。
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许多介入外科手术依赖于医学成像来可视化和跟踪仪器。这种成像方法不仅需要实时能力,而且还提供准确且强大的位置信息。在超声应用中,通常只有来自线性阵列的二维数据可用,并且由于以下三维中的精确位置估计是非微不足道的。在这项工作中,我们首先使用现实的合成训练数据训练神经网络,以估计对象与重建的超声图像中的相关轴向像差的平面外偏移。然后将获得的估计与卡尔曼滤波方法组合,该方法利用先前的时间框架中获得的定位估计来改善本地化鲁棒性并降低测量噪声的影响。使用模拟评估所提出的方法的准确性,并在使用新型光学超声成像设置获得的实验数据上证明了其实际适用性。实时提供准确和强大的位置信息。对于模拟数据的平均误差为0.1mm的平均误差,对于实验数据的平均误差为0.1mm的平均误差,轴向和横向坐标估计。三维定位最精确地高于1mm的高距距离,最大距离为25mm孔径为5mm。
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通过动态散射介质进行非侵入性光学成像具有许多重要的生物医学应用,但仍然是一项艰巨的任务。尽管标准弥漫成像方法测量光吸收或荧光发射,但也良好的是,散射的相干光的时间相关性通过组织像光强度一样扩散。然而,迄今为止,很少有作品旨在通过实验测量和处理这种时间相关数据,以证明去相关动力学的深度组织视频重建。在这项工作中,我们利用单光子雪崩二极管(SPAD)阵列摄像机同时监视单photon水平的斑点波动的时间动力学,从12种不同的幻影组织通过定制的纤维束阵列传递的位置。然后,我们应用深度神经网络将所获得的单光子测量值转换为迅速去摩擦组织幻像下散射动力学的视频。我们证明了重建瞬态(0.1-0.4s)动态事件的图像的能力,该动态事件发生在非相关的组织幻影下,并以毫米级分辨率进行重构,并突出显示我们的模型如何灵活地扩展到埋藏的phantom船只内的流速。
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Lensless cameras are a class of imaging devices that shrink the physical dimensions to the very close vicinity of the image sensor by replacing conventional compound lenses with integrated flat optics and computational algorithms. Here we report a diffractive lensless camera with spatially-coded Voronoi-Fresnel phase to achieve superior image quality. We propose a design principle of maximizing the acquired information in optics to facilitate the computational reconstruction. By introducing an easy-to-optimize Fourier domain metric, Modulation Transfer Function volume (MTFv), which is related to the Strehl ratio, we devise an optimization framework to guide the optimization of the diffractive optical element. The resulting Voronoi-Fresnel phase features an irregular array of quasi-Centroidal Voronoi cells containing a base first-order Fresnel phase function. We demonstrate and verify the imaging performance for photography applications with a prototype Voronoi-Fresnel lensless camera on a 1.6-megapixel image sensor in various illumination conditions. Results show that the proposed design outperforms existing lensless cameras, and could benefit the development of compact imaging systems that work in extreme physical conditions.
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语义图像分割是手术中的背景知识和自治机器人的重要前提。本领域的状态专注于在微创手术期间获得的传统RGB视频数据,但基于光谱成像数据的全景语义分割并在开放手术期间获得几乎没有注意到日期。为了解决文献中的这种差距,我们正在研究基于在开放手术环境中获得的猪的高光谱成像(HSI)数据的以下研究问题:(1)基于神经网络的HSI数据的充分表示是完全自动化的器官分割,尤其是关于数据的空间粒度(像素与Superpixels与Patches与完整图像)的空间粒度? (2)在执行语义器官分割时,是否有利用HSI数据使用HSI数据,即RGB数据和处理的HSI数据(例如氧合等组织参数)?根据基于20猪的506个HSI图像的全面验证研究,共注释了19个类,基于深度的学习的分割性能 - 贯穿模态 - 与输入数据的空间上下文一致。未处理的HSI数据提供优于RGB数据或来自摄像机提供商的处理数据,其中优势随着输入到神经网络的输入的尺寸而增加。最大性能(应用于整个图像的HSI)产生了0.89(标准偏差(SD)0.04)的平均骰子相似度系数(DSC),其在帧间间变异性(DSC为0.89(SD 0.07)的范围内。我们得出结论,HSI可以成为全自动手术场景理解的强大的图像模型,其具有传统成像的许多优点,包括恢复额外功能组织信息的能力。
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Multispectral imaging has been used for numerous applications in e.g., environmental monitoring, aerospace, defense, and biomedicine. Here, we present a diffractive optical network-based multispectral imaging system trained using deep learning to create a virtual spectral filter array at the output image field-of-view. This diffractive multispectral imager performs spatially-coherent imaging over a large spectrum, and at the same time, routes a pre-determined set of spectral channels onto an array of pixels at the output plane, converting a monochrome focal plane array or image sensor into a multispectral imaging device without any spectral filters or image recovery algorithms. Furthermore, the spectral responsivity of this diffractive multispectral imager is not sensitive to input polarization states. Through numerical simulations, we present different diffractive network designs that achieve snapshot multispectral imaging with 4, 9 and 16 unique spectral bands within the visible spectrum, based on passive spatially-structured diffractive surfaces, with a compact design that axially spans ~72 times the mean wavelength of the spectral band of interest. Moreover, we experimentally demonstrate a diffractive multispectral imager based on a 3D-printed diffractive network that creates at its output image plane a spatially-repeating virtual spectral filter array with 2x2=4 unique bands at terahertz spectrum. Due to their compact form factor and computation-free, power-efficient and polarization-insensitive forward operation, diffractive multispectral imagers can be transformative for various imaging and sensing applications and be used at different parts of the electromagnetic spectrum where high-density and wide-area multispectral pixel arrays are not widely available.
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In photoacoustic tomography (PAT) with flat sensor, we routinely encounter two types of limited data. The first is due to using a finite sensor and is especially perceptible if the region of interest is large relative to the sensor or located farther away from the sensor. In this paper, we focus on the second type caused by a varying sensitivity of the sensor to the incoming wavefront direction which can be modelled as binary i.e. by a cone of sensitivity. Such visibility conditions result, in the Fourier domain, in a restriction of both the image and the data to a bow-tie, akin to the one corresponding to the range of the forward operator. The visible wavefrontsets in image and data domains, are related by the wavefront direction mapping. We adapt the wedge restricted Curvelet decomposition, we previously proposed for the representation of the full PAT data, to separate the visible and invisible wavefronts in the image. We optimally combine fast approximate operators with tailored deep neural network architectures into efficient learned reconstruction methods which perform reconstruction of the visible coefficients and the invisible coefficients are learned from a training set of similar data.
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间接飞行时间(ITOF)相机是一个有希望的深度传感技术。然而,它们容易出现由多路径干扰(MPI)和低信噪比(SNR)引起的错误。传统方法,在去噪后,通过估计编码深度的瞬态图像来减轻MPI。最近,在不使用中间瞬态表示的情况下,共同去噪和减轻MPI的数据驱动方法已经成为最先进的。在本文中,我们建议重新审视瞬态代表。使用数据驱动的Priors,我们将其插入/推断ITOF频率并使用它们来估计瞬态图像。给定直接TOF(DTOF)传感器捕获瞬态图像,我们将我们的方法命名为ITOF2DTOF。瞬态表示是灵活的。它可以集成与基于规则的深度感测算法,对低SNR具有强大,并且可以处理实际上出现的模糊场景(例如,镜面MPI,光学串扰)。我们在真正深度传感方案中展示了先前方法上的ITOF2DTOF的好处。
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The International Workshop on Reading Music Systems (WoRMS) is a workshop that tries to connect researchers who develop systems for reading music, such as in the field of Optical Music Recognition, with other researchers and practitioners that could benefit from such systems, like librarians or musicologists. The relevant topics of interest for the workshop include, but are not limited to: Music reading systems; Optical music recognition; Datasets and performance evaluation; Image processing on music scores; Writer identification; Authoring, editing, storing and presentation systems for music scores; Multi-modal systems; Novel input-methods for music to produce written music; Web-based Music Information Retrieval services; Applications and projects; Use-cases related to written music. These are the proceedings of the 3rd International Workshop on Reading Music Systems, held in Alicante on the 23rd of July 2021.
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Spatially varying spectral modulation can be implemented using a liquid crystal spatial light modulator (SLM) since it provides an array of liquid crystal cells, each of which can be purposed to act as a programmable spectral filter array. However, such an optical setup suffers from strong optical aberrations due to the unintended phase modulation, precluding spectral modulation at high spatial resolutions. In this work, we propose a novel computational approach for the practical implementation of phase SLMs for implementing spatially varying spectral filters. We provide a careful and systematic analysis of the aberrations arising out of phase SLMs for the purposes of spatially varying spectral modulation. The analysis naturally leads us to a set of "good patterns" that minimize the optical aberrations. We then train a deep network that overcomes any residual aberrations, thereby achieving ideal spectral modulation at high spatial resolution. We show a number of unique operating points with our prototype including dynamic spectral filtering, material classification, and single- and multi-image hyperspectral imaging.
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我们展示了OpenFWI,是用于地震全波形反演(FWI)的大型开源基准数据集的集合。OpenFWI是地球科学和机器学习界的一流,以促进对基于机器学习的FWI多元化,严谨和可重复的研究。OpenFWI包括多个尺度的数据集,包含不同的域,涵盖各种级别的模型复杂性。除了数据集之外,我们还对每个数据集进行实证研究,具有完全卷积的深度学习模型。OpenFWI已被核心维护,并将通过新数据和实验结果定期更新。我们感谢社区的投入,帮助我们进一步改进OpenFWI。在当前版本,我们在OpenFWI中发布了七个数据集,其中为3D FWI指定了一个,其余的是2D场景。所有数据集和相关信息都可以通过我们的网站访问https://openfwi.github.io/。
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从历史上看,患者数据集已用于开发和验证PET/MRI和PET/CT的各种重建算法。为了使这种算法开发,无需获得数百个患者检查,在本文中,我们展示了一种深度学习技术,可以从丰富的全身MRI中产生合成但逼真的全身宠物纹状体。具体来说,我们使用56 $^{18} $ F-FDG-PET/MRI考试的数据集训练3D残差UNET来预测全身T1加权MRI的生理PET摄取。在训练中,我们实施了平衡的损失函数,以在较大的动态范围内产生逼真的吸收,并沿着层析成像线的响应线对模仿宠物的获取产生计算的损失。预测的PET图像预计会产生合成宠物飞行时间(TOF)正式图,可与供应商提供的PET重建算法一起使用,包括使用基于CT的衰减校正(CTAC)和基于MR的衰减校正(MRAC(MRAC) )。由此产生的合成数据概括了生理学$^{18} $ f-fdg摄取,例如高摄取量位于大脑和膀胱,以及肝脏,肾脏,心脏和肌肉的吸收。为了模拟高摄取的异常,我们还插入合成病变。我们证明,该合成PET数据可以与实际PET数据互换使用,用于比较CT和基于MR的衰减校正方法的PET量化任务,与使用真实数据相比,在平均值中实现了$ \ leq 7.6 \%$误差。这些结果共同表明,所提出的合成PET数据管道可以合理地用于开发,评估和验证PET/MRI重建方法。
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光学系统的可区分模拟可以与基于深度学习的重建网络结合使用,以通过端到端(E2E)优化光学编码器和深度解码器来实现高性能计算成像。这使成像应用程序(例如3D定位显微镜,深度估计和无透镜摄影)通过优化局部光学编码器。更具挑战性的计算成像应用,例如将3D卷压入单个2D图像的3D快照显微镜,需要高度非本地光学编码器。我们表明,现有的深网解码器具有局部性偏差,可防止这种高度非本地光学编码器的优化。我们使用全球内核傅里叶卷积神经网络(Fouriernets)基于浅神经网络体系结构的解码器来解决此问题。我们表明,在高度非本地分散镜头光学编码器捕获的照片中,傅立叶网络超过了现有的基于网络的解码器。此外,我们表明傅里叶可以对3D快照显微镜的高度非本地光学编码器进行E2E优化。通过将傅立叶网和大规模多GPU可区分的光学模拟相结合,我们能够优化非本地光学编码器170 $ \ times $ \ times $ tos 7372 $ \ times $ \ times $ \ times $比以前的最新状态,并证明了ROI的潜力-type特定的光学编码使用可编程显微镜。
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在本文中,我们考虑使用Palentir在两个和三个维度中对分段常数对象的恢复和重建,这是相对于当前最新ART的显着增强的参数级别集(PALS)模型。本文的主要贡献是一种新的PALS公式,它仅需要一个单个级别的函数来恢复具有具有多个未知对比度的分段常数对象的场景。我们的模型比当前的多对抗性,多对象问题提供了明显的优势,所有这些问题都需要多个级别集并明确估计对比度大小。给定对比度上的上限和下限,我们的方法能够以任何对比度分布恢复对象,并消除需要知道给定场景中的对比度或其值的需求。我们提供了一个迭代过程,以找到这些空间变化的对比度限制。相对于使用径向基函数(RBF)的大多数PAL方法,我们的模型利用了非异型基函数,从而扩展了给定复杂性的PAL模型可以近似的形状类别。最后,Palentir改善了作为参数识别过程一部分所需的Jacobian矩阵的条件,因此通过控制PALS扩展系数的幅度来加速优化方法,固定基本函数的中心,以及参数映射到图像映射的唯一性,由新参数化提供。我们使用X射线计算机断层扫描,弥漫性光学断层扫描(DOT),Denoising,DeonConvolution问题的2D和3D变体证明了新方法的性能。应用于实验性稀疏CT数据和具有不同类型噪声的模拟数据,以进一步验证所提出的方法。
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对医疗保健监控的远程工具的需求从未如此明显。摄像机测量生命体征利用成像装置通过分析人体的图像来计算生理变化。建立光学,机器学习,计算机视觉和医学的进步这些技术以来的数码相机的发明以来已经显着进展。本文介绍了对生理生命体征的相机测量综合调查,描述了它们可以测量的重要标志和实现所做的计算技术。我涵盖了临床和非临床应用以及这些应用需要克服的挑战,以便从概念上推进。最后,我描述了对研究社区可用的当前资源(数据集和代码),并提供了一个全面的网页(https://cameravitals.github.io/),其中包含这些资源的链接以及其中引用的所有文件的分类列表文章。
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最初在具有基于图像的图像的机器人和自主驾驶等领域开发的领域,基于图像的单图像深度估计(侧面)发现了对更广泛的图像分析界的兴趣。遥感也不例外,因为在地形重建的背景下估计来自单个空中或卫星图像的高度地图的可能性很大。少数开创性的调查已经证明了从光学遥感图像的单个图像高度预测的一般可行性,并激发了这种方向的进一步研究。借鉴了本文,我们介绍了对遥感中的其他重要传感器模式的基于深度学习的单图像高度预测的第一次演示:合成孔径雷达(SAR)数据。除了用于SAR强度图像的卷积神经网络(CNN)架构的适应外,我们还为不同SAR成像模式和测试站点提供了用于生成训练数据的工作流程,以及广泛的实验结果。由于我们特别强调可转换性,我们能够确认基于深度的学习的单图像高度估计不仅可能,而且也是不可能的,而且也转移到未经看的数据,即使通过不同的成像模式和成像参数获取。
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我们在并行计算机架构上的图像的自适应粒子表示(APR)上的离散卷积运算符的本机实现数据结构和算法。 APR是一个内容 - 自适应图像表示,其本地地将采样分辨率局部调整到图像信号。已经开发为大,稀疏图像的像素表示的替代方案,因为它们通常在荧光显微镜中发生。已经显示出降低存储,可视化和处理此类图像的存储器和运行时成本。然而,这要求图像处理本身在APRS上运行,而无需中间恢复为像素。然而,设计高效和可扩展的APR-Native图像处理原语是APR的不规则内存结构的复杂性。这里,我们提供了使用可以在离散卷积方面配制的各种算法有效和本地地处理APR图像所需的算法建筑块。我们表明APR卷积自然地导致缩放 - 自适应算法,可在多核CPU和GPU架构上有效地平行化。与基于像素的算法和概念性数据的卷积相比,我们量化了加速度。我们在单个NVIDIA GeForce RTX 2080 Gaming GPU上实现了最多1 TB / s的像素等效吞吐量,而不是基于像素的实现的存储器最多两个数量级。
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强度衍射断层扫描(IDT)是指用于从一组仅2D强度测量的样品成像样品的3D折射率(RI)分布的一类光学显微镜技术。由于相位信息的丢失和缺失的锥体问题,无伪影RI地图的重建是IDT的一个基本挑战。神经领域(NF)最近成为一种新的深度学习方法(DL),用于学习物理领域的连续表示。 NF使用基于坐标的神经网络来表示该场,通过将空间坐标映射到相应的物理量,在我们的情况下,复杂价值的折射率值。我们将DEPAF作为第一种基于NF的IDT方法,可以从仅强度和有限角度的测量值中学习RI体积的高质量连续表示。 DECAF中的表示形式是通过使用IDT向前模型直接从测试样品的测量值中学到的,而无需任何地面真相图。我们对模拟和实验生物学样品进行定性和定量评估DECAF。我们的结果表明,DECAF可以生成高对比度和无伪影RI图,并导致MSE超过现有方法的2.1倍。
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